В 1939 году юннатские кружки были организованы в Зинаидинской, Вышнепенской, Васильевской, Бобравской четырехлетних школах, Дмитриевской семилетней школе.
В 1962 году Ракитянский район объединили с Краснояружским. И в 1959 году в районе появилась первая станция юных натуралистов. Размещалась она в помещении Бехтеевской начальной школы.
В 1960 году началось строительство отдельного здания Станции на месте бывшего лесопитомника совхоза. К участку были подведены коммуникации: вода, свет.
Учебный год, 1 сентября 1961, юннаты встретили в новом красивом здании станции с уютными учебными кабинетами, игровой комнатой и библиотекой.
В 1991 году Краснояружский район был восстановлен. Юннатское движение курировал районный отдел народного образования и Дом пионеров (с 1995 г. - Дом детских общественных организаций, с 1999 года - в Дом детского творчества).
Ракитянская станция юных натуралистов была организована только в 2008 году. Располагалась на базе МОУ «Пролетарская СОШ №1». Директором станции была назначена Эсауленко Ольга Михайловна – опытный учитель биологии Ракитянского района. На станции работали педагоги-энтузиасты, влюбленные в свое дело – Смыслова Татьяна Павловна, Густова Галина Ивановна, Светличная Светлана Ивановна, Якименко Татьяна Юрьевна. С 2016 года директором была Шелист Ольга Сергеевна, а с 2019 года Глущенко Светлана Михайловна.
С 2008 года согласно лицензии на образовательную деятельность учреждение именуется муниципальным образовательным учреждением дополнительного образования детей «Ракитянская станция юных натуралистов. С 2014 года - муниципальным бюджетным учреждением дополнительного образования «Ракитянская станция юных натуралистов».
В настоящее время Ракитянская станция юных натуралистов находится в здании МБУК «Культурно-исторический центр имени князей Юсуповых в п. «Ракитное»